Majstor nindžucua Hamato Joši (Splinter) šetajući ulicama Menhetna sa svojim ljubimcima, četiri kornjače, susreće članove vazemaljske rase zvane Krang. Tokom prepirke sa ovim vanzemaljcima, Hamato Joši i njegove kornjače bivaju izložene mutagenu, Krangovskoj supstanci koja živa bića transofrmiše u razne oblike.
Joši zauzima oblik pacova, dok se kornjače razvijaju dobijajući mnoštvo ljudskih osobina. Splinter, zajedno sa svojim koranjačama, odlazi u njujoršku kanalizaciju u kojoj podiže kornjače kao svoje sinove i daje im svoje znanje nindžicua.